Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms