Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.2 ms