Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGXB3Q12766 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGXB3Q12766 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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