Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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HOXD10P28358 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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HOXD10P28358 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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HOXD10P28358 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HOXD10P28358 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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