Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CRXO43186 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CRXO43186 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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