Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGEF1Q9Y6D6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGEF1Q9Y6D6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGEF1Q9Y6D6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGEF1Q9Y6D6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGEF1Q9Y6D6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGEF1Q9Y6D6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGEF1Q9Y6D6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGEF1Q9Y6D6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGEF1Q9Y6D6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGEF1Q9Y6D6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGEF1Q9Y6D6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGEF1Q9Y6D6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGEF1Q9Y6D6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFGEF1Q9Y6D6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms