Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms