Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms