Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBP3Q9NS15 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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