Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenooQ9DBC0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelenooQ9DBC0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms