Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED3Q96IU2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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