Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms