Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms