Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
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UBE2Q1Q7Z7E8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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UBE2Q1Q7Z7E8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
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UBE2Q1Q7Z7E8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2Q1Q7Z7E8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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UBE2Q1Q7Z7E8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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UBE2Q1Q7Z7E8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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UBE2Q1Q7Z7E8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
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UBE2Q1Q7Z7E8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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UBE2Q1Q7Z7E8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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UBE2Q1Q7Z7E8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms