Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGAP27Q6ZUM4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP27Q6ZUM4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms