Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RFTN2Q52LD8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms