Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Garem1Q3UFT3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garem1Q3UFT3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms