Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms