Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHD4Q14839 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
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