Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATMQ13315 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATMQ13315 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATMQ13315 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATMQ13315 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATMQ13315 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATMQ13315 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATMQ13315 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATMQ13315 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATMQ13315 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATMQ13315 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATMQ13315 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATMQ13315 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATMQ13315 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATMQ13315 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATMQ13315 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATMQ13315 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATMQ13315 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATMQ13315 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATMQ13315 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATMQ13315 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATMQ13315 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATMQ13315 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATMQ13315 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATMQ13315 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATMQ13315 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATMQ13315 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATMQ13315 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATMQ13315 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATMQ13315 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATMQ13315 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATMQ13315 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATMQ13315 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATMQ13315 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATMQ13315 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATMQ13315 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATMQ13315 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATMQ13315 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATMQ13315 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATMQ13315 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATMQ13315 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATMQ13315 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATMQ13315 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms