Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RykQ01887 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RykQ01887 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RykQ01887 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RykQ01887 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RykQ01887 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RykQ01887 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RykQ01887 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RykQ01887 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RykQ01887 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RykQ01887 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RykQ01887 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RykQ01887 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RykQ01887 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RykQ01887 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RykQ01887 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RykQ01887 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RykQ01887 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RykQ01887 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RykQ01887 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RykQ01887 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms