Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms