Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TfamP40630 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TfamP40630 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TfamP40630 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TfamP40630 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TfamP40630 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TfamP40630 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms