Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prim2P33610 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prim2P33610 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms