Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRBP28702 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRBP28702 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRBP28702 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRBP28702 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRBP28702 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRBP28702 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRBP28702 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRBP28702 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRBP28702 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRBP28702 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRBP28702 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRBP28702 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRBP28702 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRBP28702 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRBP28702 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRBP28702 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRBP28702 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRBP28702 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRBP28702 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRBP28702 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RXRBP28702 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RXRBP28702 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RXRBP28702 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRBP28702 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRBP28702 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRBP28702 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRBP28702 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRBP28702 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRBP28702 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRBP28702 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRBP28702 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRBP28702 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRBP28702 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRBP28702 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRBP28702 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRBP28702 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRBP28702 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRBP28702 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRBP28702 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRBP28702 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRBP28702 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRBP28702 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRBP28702 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRBP28702 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRBP28702 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRBP28702 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRBP28702 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRBP28702 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRBP28702 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRBP28702 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRBP28702 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRBP28702 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRBP28702 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRBP28702 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRBP28702 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRBP28702 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRBP28702 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRBP28702 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRBP28702 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RXRBP28702 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms