Protein–RNA interactions for Protein: P25398

RPS12, 40S ribosomal protein S12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS12P25398 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS12P25398 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS12P25398 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS12P25398 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS12P25398 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS12P25398 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS12P25398 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS12P25398 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS12P25398 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS12P25398 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS12P25398 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS12P25398 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS12P25398 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS12P25398 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS12P25398 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS12P25398 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS12P25398 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS12P25398 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS12P25398 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS12P25398 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS12P25398 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS12P25398 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS12P25398 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS12P25398 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS12P25398 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS12P25398 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS12P25398 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS12P25398 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS12P25398 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS12P25398 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS12P25398 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS12P25398 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS12P25398 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS12P25398 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS12P25398 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS12P25398 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS12P25398 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS12P25398 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS12P25398 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS12P25398 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS12P25398 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS12P25398 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS12P25398 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS12P25398 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS12P25398 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS12P25398 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS12P25398 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS12P25398 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS12P25398 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS12P25398 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS12P25398 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS12P25398 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS12P25398 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS12P25398 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS12P25398 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS12P25398 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPS12P25398 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS12P25398 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS12P25398 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS12P25398 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS12P25398 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS12P25398 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS12P25398 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS12P25398 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS12P25398 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS12P25398 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS12P25398 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS12P25398 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS12P25398 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS12P25398 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS12P25398 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS12P25398 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS12P25398 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS12P25398 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS12P25398 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms