Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18530 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18530 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18530 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18530 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18530 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18530 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18530 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18530 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18530 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18530 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18530 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18530 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18530 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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