Protein–RNA interactions for Protein: O88909

Slc22a8, Solute carrier family 22 member 8, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a8O88909 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc22a8O88909 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms