Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUBNO60494 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUBNO60494 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUBNO60494 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUBNO60494 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUBNO60494 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUBNO60494 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUBNO60494 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUBNO60494 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CUBNO60494 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CUBNO60494 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUBNO60494 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUBNO60494 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUBNO60494 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CUBNO60494 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CUBNO60494 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUBNO60494 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUBNO60494 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUBNO60494 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms