Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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