Protein–RNA interactions for Protein: J3QLI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLI3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QLI3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QLI3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms