Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm20828J3KMI7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm20828J3KMI7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm20828J3KMI7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm20828J3KMI7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm20828J3KMI7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm20828J3KMI7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm20828J3KMI7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm20828J3KMI7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm20828J3KMI7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm20828J3KMI7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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