Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r39G3UWE6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r39G3UWE6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms