Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10477F6SW83 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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