Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms