Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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