Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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HOXD1Q9GZZ0 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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HOXD1Q9GZZ0 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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HOXD1Q9GZZ0 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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HOXD1Q9GZZ0 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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HOXD1Q9GZZ0 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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