Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms