Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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