Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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