Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms