Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms