Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USF2Q15853 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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