Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TRIP13Q15645 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIP13Q15645 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIP13Q15645 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms