Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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