Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms