Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
FRMPD4Q14CM0 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
FRMPD4Q14CM0 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
FRMPD4Q14CM0 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
FRMPD4Q14CM0 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
FRMPD4Q14CM0 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
FRMPD4Q14CM0 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FRMPD4Q14CM0 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms