Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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NFIXQ14938 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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