Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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