Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
MDC1Q14676 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms